A序列比对可以用来寻找和确定同源基因，以及帮助确定基因的功能B我们可以通过同源基因之间相似度的差异，来进行推断它们的亲缘关系，构建这些同源基因演化的历史C我们可以通过多个序列的比对，来了解这样一个同源基因家族，他们所具备的共同特征D序列比对可以用来调查基因的基因的多态性情况